Malarczyk zadebiutował w pierwszej drużynie Korony w 2009 roku. Od tego czasu rozegrał dla macierzystego klubu 228 meczów, w których zdobył 13 goli i dwie asysty. W sezonie 14/15 był kapitanem zespołu Ryszarda Tarasiewicza.
Na początku kolejnej kampanii był bohaterem dużego transferu do brytyjskiego Ipswich. Na Wyspach nie zagrzał jednak długo miejsca. Wrócił do Polski, gdzie grał dla Cracovii, ponowie Korony i Piasta Gliwice.
W sezonie 21/22 znów pojawił się przy Ściegiennego. Z Koroną najpierw wywalczył awans do ekstraklasy, a następnie dwukrotnie utrzymał się w elicie. W minionych rozgrywkach zaliczył 22 spotkania.
33-latek podpisał nową umowę do 2025 roku.